墨脱国家级自然保护区位于西藏自治区林芝市墨脱县境内的米什米山脉北部,面积62620公顷,海拔750-4800米。1985年经西藏自治区人民政府批准建立,1986年晋升国家级,主要保护对象为山地森林垂直景观及珍稀动植物。它是中国跨自然带最多的自然保护区。2000年4月正式将墨脱国家级自然保护区扩界并更名为雅鲁藏布大峡谷国家级自然保护区。
墨脱国家级自然保护区虽处于亚热带纬度地区,但由于其特殊的地理环境,发育着热带到寒温带的不同山地森林植被类型,保存着丰富的物种资源。高等植物有3000多种,约占全国的1/10,其中国家重点保护动物21种,以墨脱命名的特有植物40多种。国家重点保护动物有羚牛、长尾中猴、熊猴、虎、墨脱缺翅虫等42种。被誉为西藏的“天然动植物博物馆”,是研究不同气候带生态系统的重要基地。