主殿采用抬梁式木构架，12根坤甸木柱直径达40厘米，历经两百余年仍巍然耸立。前檐的如意斗拱层层出挑，形成极具视觉张力的歇山屋顶，瓦当上清晰可见光绪年间烧制的「長洲北帝廟」铭文。
香港长洲北帝庙，作为全港最古老的北帝信仰场所，自1783年建成以来始终是离岛居民的精神支柱。这座融合道教文化与岭南工艺的古建筑群，以精妙绝伦的营造技艺和跌宕起伏的传奇往事，成为香港文化遗产的重要象征。
正门彩绘秦叔宝、尉迟恭门神像，采用矿物颜料绘制，至今色彩明艳
屋脊双龙戏珠陶塑长达8米，由石湾名师文如璧于1894年重塑
花岗岩浮雕墙基刻画八仙法器，暗含道教五行八卦原理
据《长洲志》记载，乾隆年间海盗张保仔舰队肆虐珠江口，渔民从惠州迎来北帝分灵建庙。1813年庙前出土宋代祥符通宝，更添神秘色彩。
1900年岛上瘟疫流行，信众恭请北帝銮驾巡境后疫情奇迹消退，自此形成每年农历三月初三的太平清醮，其「抢包山」活动于2006年被列为国家级非物质文化遗产。
庙内保存着1895年铸造的青铜北帝像及清代铁铸香炉，与当代艺术家创作的电子祈福装置形成跨越时空的对话。2018年完成的防水防潮修缮工程，采用传统桐油灰工艺与现代纳米涂层相结合的技术，展现文化遗产保护的创新思维。
当晨曦洒在庙前的麒麟照壁上，这座历经台风战火依然屹立的古建筑，仍在诉说着香港海洋文明的集体记忆。每一道斑驳的砖缝，都是城市精神生生不息的见证。
